市场上的对冲基金主要是从策略的不同进行区分的。
股票多空是最常见的对冲基金采用的策略。通过同时建立股票多头和空头，削弱市场波动的风险，空头和多头的相互抵消获取绝对收益。不管对于牛市或者熊市，或者即使基金经理判断错误了市场的方向，但是依然可以通过两个头寸的相对业绩，带来正向收益。
单向做空也是比较常见的对冲基金采取的策略。寻找那些被高估的公司，借入这些公司的股票并卖出，等待这些股价下跌，低价买入而盈利。这个策略相对而言风险系数更高一些。
中性策略，创建一种投资组合，与市场涨跌无关，取得绝对收益。比如说货币中性，贝塔中性，行业中性，因子中性等。
困境证券策略，专注于市场上那些遇到金融困境、违约甚至破产的公司的股票。从信息不对称中获取利益。比如说重组或者停止运营中，通过出售部分业务来获得良好收益；国家的监管允许困境证券的投资者进行资产剥离，并且将不良资产重新打包等风险套利策略，从公司的并购或重组等活动中获得收益，套利基金买入这些公司的股票，赚取从信息发布之后价格与交易价格的差价。
可转债套利策略，可转债一定的情况下可以转化为股票，可转债经常低于其公允价值发行的，充分利用中间的套利机会。
固定收益套利策略，最基本的工具就是利率期限结构。
除了以上，还有投资方法论和商品交易顾问策略。