巴塞尔协议2存在的问题：
从金融监管方面的缺陷。其关于金融监管的理念仍停留再机构性监管层面，增加监管套利可能性，增加资源损失，降低监管机构的监管效力。由于巴塞尔协议2仍然是以行业作为区分标准进行机构监管，并没有将投资银行纳入监管范围，其次是对金融衍生品的监管缺失
监管指标具有顺周期效应且规则相对宏观，缺少对银行的内部监管。
多模型的应用，导致了监管套利。
各模型之间缺少可比性，且模型比较复杂。
风险度量方面缺陷，风险覆盖能力不足，体现在资本充足率的分子分母上。缺乏对流动性风险的管理，系统性风险过高。var模型置信区间的设定导致尾部风险无法估计
放大了顺经济周期效应，银行贷款违约会增加，信用等级必然下降
资本充足率分子资本金的标准不严，资本充足率不够，标准不够严格