ETF“实物申购与赎回”机制是这一产品结构的精髓，正是这一机制才迫使ETF价格与净值趋于一致，极大地减少了ETF折（溢）价幅度。在大多数情况下，套利一定需要进行申购或赎回，现将ETF的套利行为简要说明如下：
首先，当ETF在交易所市场的报价低于其资产净值时，也就是产生折价时，机构可以在二级市场以低于资产净值的价格大量买进ETF，然后于一级市场赎回一篮子股票，再于二级市场中卖掉股票，赚取之间的差价。这一套利机制，将可促使ETF在交易所市场的交易价格受到机构套利买盘进场而带动报价上扬，缩小其折价差距，产生让ETF的市场交易价格与基金份额净值趋于一致的效果。
其次，当ETF在交易所市场的报价高于其资产净值时，也就是发生溢价时，机构可以在二级市场买进一篮子股票，然后于一级市场申购ETF，再于二级市场中以高于基金份额净值的价格将此申购得到的ETF卖出，赚取之间的差价。这一套利机制，将可促使ETF在交易所市场的交易价格收到机构套利卖盘进场而带动报价下跌，缩小其溢价差距，同样产生让ETF的市场交易价格与基金份额净值趋于一致的效果。
也正是由于此一套利机制，让机构乐于积极地参与ETF交易，进而带动ETF市场的活跃。当套利活动在交易所ETF市场上比较活跃时，ETF的折、溢价空间将会逐渐缩小；当ETF在交易所市场的报价与资产净值趋于一致时，又会加强一般中小投资人投资ETF的意愿，进而促使整体ETF市场更加蓬勃发展。因此，此一套利机制是促使机构与中小投资人积极进场的非常关键因素，也是塑造一只成功ETF不可或缺的重要因素。