不同性质的企业其税率存在着差异，企业经营的产品项目不同，税率也同样存在着差异性。
前面已经介绍，不同性质的企业其税率不同。咨询公司可以分为两种性质，第一种是有限公司性质咨询企业，第二种就是个人独资公司性质的企业，当然也有工作室形式的咨询公司，其实工作室形式的咨询单位，与个人独资企业性质都是一样的，都不是严格意义上的独立法人。因此第二种咨询公司不需要缴纳企业所得税，而需要缴纳个人所得税，以第一种形式存在着的咨询公司，由于具备独立法人资格，因此需要缴纳企业所得税。
个人独资企业形式的咨询公司，其税率为3%左右，而以有限公司形式存在的咨询公司，其需要缴纳企业所得税，印刷税、附加税等，同时对于有限公司的负责人来讲，还需要缴纳个人所得税。有人认为，以有限公司形式存在着的咨询公司，其缴纳的税种多，而且综合税率相对来讲也比较高。当然，对于一般小规模的咨询公司来讲，大多数以个人独资企业形式注册，而对于大型咨询公司来讲，大多采用的是有限公司注册，因为大型咨询公司综合竞争力强大，咨询服务的业务价格高，服务业务量也多。而选择咨询公司的注册形式，要综合参考企业发展的目标，咨询服务业务量等。采用合适的注册形式，才能够有助于咨询公司的发展。